Der Bundesverband hat 1999 den Arbeitskreis Bürgerstiftungen ins Leben gerufen. Seitdem gehören Erfahrungsaustausch und Information gleichermaßen zu den drei jährlichen Treffen wie das Engagement für gute Rahmenbedingungen für Bürgerstiftungen.

Im Jahr 2000 formulierten die Teilnehmer des Arbeitskreises die "10 Merkmale einer Bürgerstiftung", die seither in aller Regel bei der Errichtung einer Bürgerstiftung als Richtlinie herangezogen werden. An die Stiftungen, die diesen Merkmalen in Satzung und Arbeitsweise entsprechen, wird für eine Gültigkeitsdauer von jeweils zwei Jahren das Gütesiegel des Bundesverbandes verliehen. Das Gütesiegel ist in der Stiftungslandschaft bisher einmalig. Der 1. Oktober jedes Jahres ist deutschlandweit der "Tag der Bürgerstiftungen".

Zur Unterstützung, Beratung und Vernetzung der Bürgerstiftungen hat 2002 die vom Bundesverband und mehreren großen privaten Stiftungen unterstützte "Initiative Bürgerstiftungen" ihre Arbeit aufgenommen. In zehn Bundesländern beraten Regionalkuratoren Gründungsinitiativen vor Ort.